Corynebacterium striatum izolatlarının antimikrobiyal duyarlılıklarının, biyofilm üretimlerinin ve klonal analizlerinin değerlendirilmesi
Tezin Türü: Tıpta Uzmanlık
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Sağlık Bilimleri Üniversitesi, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2020
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: FATMA YAŞAR
Danışman: İpek MUMCUOĞLU
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Amaç: Bu çalışmada tıbbi mikrobiyoloji laboratuvarına gelen örneklerden izole edilen ve etken ya da kontaminant olarak değerlendirilen C. striatum izolatlarının antimikrobiyal duyarlılık testleri, biyofilm üretme kabiliyetleri, genotipleri karşılaştırılmış, hastaların demografik özellikleri incelenmiş ve C.striatum'un klinik önemini etkileyen faktörlerin belirlenmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Çalışmaya Ankara Numune Eğitim ve Araştırma Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji laboratuvarına 1 Kasım 2018 - 30 Nisan 2019 tarihleri arasında gönderilen çeşitli klinik örneklerden izole edilen 58 C. striatum izolatı dahil edilmiştir. Klinisyen tarafından bu izolatların 29'u enfeksiyon etkeni olarak, diğer 29'u kontaminasyon-kolonizasyon olarak değerlendirilmiştir. Hastaların kültür alındığı anda hastanede yatış günü, altta yatan hastalık varlığı (diabetes mellitus, nörolojik hastalık, iskemik kalp hastalığı, kronik böbrek hastalığı, solid tümör), son bir ay içerisinde geçirilen cerrahi, daha önceki antimikrobiyal kullanımı incelenmiştir. Çalışmaya dahil edilen 58 C. striatum izolatından 13 tanesi etken gruptan, 13 tanesi kontaminasyon-kolonizasyon grubundan seçilerek 26 izolatın antimikrobiyal duyarlılık testleri yapılmıştır. Antimikrobiyal duyarlılık testleri, gradiyent strip yöntemiyle yapılmıştır ve EUCAST standartlarına göre değerlendirilmiştir. Çalışmaya alınan tüm suşlarda biyofilm oluşumu negatif yüklü polistren yüzeylerde 96 kuyucuklu mikrotitre plaklarında belirlenmiştir. Klonal analiz için izolatlar PFGE yöntemiyle Xba1 enzimi kullanılarak değerlendirilmiştir. Bulgular: Çalışmaya alınan iki hasta grubunda demografik özellikler açısından fark olmadığı izlenmiştir. Nörolojik hastalığı olanlarda C.striatum etken olarak daha sık izlenirken (p=0,025), diğer komorbiditelerin iki grup arasında farklı olmadığı görülmüştür. Poliklinik hastalarından izole edilen suşların kontaminasyon veya kolonizasyon kabul edilme oranının daha yüksek olduğu anlaşılmıştır (p=0,034). Antimikrobiyal duyarlılık testlerinde her iki grupta da yaygın çoklu ilaç direnci olduğu izlenmiştir. Gruplar arasında antimikrobiyal duyarlılık açısından anlamlı bir fark olmadığı görülmüştür. Biyofilm üretiminin etken grupta anlamlı şekilde daha yüksek olduğu tespit edilmiştir (p=0,015). Genotipik değerlendirmede, izolatların çok farklı PFGE paternleri gösterdiği ve klonal olarak birbiriyle ilişkili olmadığı belirlenmiştir. Sonuç: C. striatum cilt ve mukoz membranların normal florasında bulunmakla birlikte, son yıllarda artan sıklıkta enfeksiyon etkeni olarak da bildirilmektedir. Kültürde C. striatum izole edildiğinde, enfeksiyon etkeni, kontaminasyon veya kolonizasyon olduğunu belirlemek sıklıkla çoklu ilaç direnci olan bu mikroorganizmanın tedavisinde çok önemlidir. Bu çalışmada, enfeksiyon oluşumunda C.striatum izolatlarının genotipleri ve direnç paternlerinden ziyade, bakteriye ait virulans faktörlerinin ve hastaya özgül değişkenlerin önemli olduğu belirlenmiştir. Anahtar kelimeler: C. striatum, antimikrobiyal direnç, biyofilm