Prostat adenokarsinomlarında dijital fotoğraf formatı ve görüntü sıkıştırmanın tanı doğruluğu ve gleason skoru tekrarlanabilirliği üzerine etkisinin araştırılması
Tezin Türü: Tıpta Uzmanlık
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Sağlık Bilimleri Üniversitesi, ANKARA DIŞKAPI YILDIRIM BEYAZIT SAĞLIK UYGULAMA VE ARAŞTIRMA MERKEZİ, CERRAHİ TIP BİLİMLERİ BÖLÜMÜ, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2017
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: FATMA AKSOY KHURAMİ
Danışman: Murat ALPER
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:ÖZET Amaç: Prostat adenokarsinomu erkeklerde en sık kanser türlerinden biri olup 1970'li yıllardan itibaren Donald Gleason'ın geliştirdiği sistem baz alınarak skorlanmaktadır. Literatürde Gleason skorunun gözlemci ici ve gözlemciler arası tekrarlanabilirliğinin incelendiği pek çok çalışma mevcuttur. Bu çalışmanın amacı Gleason skorunun gözlemci içi ve gözlemciler arası tekrarlanabilirliğini farklı fotoğraf formatları kullanarak dijital ortamda test etmektir. Gereç ve Yöntem: Literatürdeki çalışmaların bir kısmında, prostat tümörlerinin farklı merkezlerdeki gözlemcilere ulaştırılması için WSI ve/veya bir alandan çekilmiş fotoğrafları kullanılmıştır. Bizim çalışmamızda 3 farklı gözlemci, 198 vakayı, öncelikle ışık mikroskopunda bireysel olarak değerlendirmişlerdir. Gözlemci 1 inceleme sırasında verdiği skoru temsil eden alanı işaretlemiş olup, diğer gözlemciler bu alanı baz alarak olgulara skor vermişlerdir. Daha sonra gözlemci 2 işaretli alanların fotoğrafını çekerek 5 farklı fotoğraf formatına (TIFF, GIF, BMP, JPEG, PNG) çevirmiştir. Tüm gözlemciler 5 farklı formattaki değerlendirmelerini tamamladıktan gözlemci içi ve gözlemciler arası uyum yüzdelerine bakılmıştır. Bulgular ve Sonuç: Değerlendirme tamamlandığında patern 4 nedeniyle uyum yüzdeleri ve kappa değerlerinde belirgin kötüleşme olduğu dikkati çekmiştir. Bu durum metin içinde belirtilen yeni kategorizasyon sistemine geçiş ile elimine edilmiştir. Maksimum uyum yüzdesi % 94,3 ve minimum uyum yüzdesi %31,4 olarak hesaplanmıştır. Ayrıca maksimum kappa değeri 0,784 ve minimum kappa değeri 0,624'tür. Yapılan tekrarlı ölçümler arasında anlamlı farklılık tespit edilmiş olup, bu farklılığın Gözlemci 1'in ışık mikroskopunda yaptığı değerlendirme ile BMP formatındaki değerlendirmesi (p=0,029) arasında, Gözlemci 3'ün TIFF formatındaki değerlendirmesi ile JPEG formatındaki değerlendirmesi (p=0,021) arasındaki anlamlı farklılık sebebiyle olduğu gözlenmiştir. Gözlemci 2'nin ışık mikroskopundaki değerlendirmesi ile formatlar arasında anlamlı farklılık yoktur. Bu skorlamalar dışında gözlemcilerin kendi içlerinde (intraobserver) farklı fotoğraf formatlarındaki değerlendirmeleri arasında anlamlı farklılık bulunmamıştır. Artefakt varlığı ile tanı tekrarlanabilirliği arası ilişkinin test edildiği değerlendirmede p=0,722 olarak hesaplanmıştır. Artefakt varlığının tanı üzerinde anlamlı bir farklılık oluşturmadığı düşünülmüştür. Üç gözlemcide, değişik fotoğraf formatlarında istatistiksel olarak anlamlı düzeyde farklılık tespit edilmiştir. Bu durum gözlemcilerin kişisel farklılıklarından kaynaklanıyor olabilir. Daha geniş gruplarda, WSI görüntüler alınarak, format çeşitliliği arttırılarak yapılacak yeni çalışmalar ile fotoğraf formatlarının Gleason skoru tekrarlanabilirliğindeki etkisi araştırılmalıdır.