Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyon iyonizasyon uçuş zamanı kütle spektrometresi aracılığıyla periapikal indekse göre sınıflandırılmış periapikal doku hastalıklarındaki kök kanal mikrobiyota profillerinin incelenmesi
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Sağlık Bilimleri Üniversitesi, GÜLHANE DİŞ HEKİMLİĞİ FAKÜLTESİ (ANKARA), KLİNİK BİLİMLER BÖLÜMÜ, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2019
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: METE AHLAT
Danışman: Ömer Cumhur AYDIN
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Amaç: Çalışmanın amacı, periapikal indekse (PAI) göre sınıflandırılmış periapikal doku hastalıklarındaki kök kanal mikrobiyota profillerinin MALDI-TOF MS (Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyon iyonizasyon uçuş zamanı kütle spektrometresi) aracılığıyla tanımlanmasını araştırmaktır. Gereç ve Yöntem: Çalışmaya Gülhane Diş Hekimliği Fakültesi Endodonti Ana Bilim Dalı'na tedavi amacıyla başvuran sistemik olarak sağlıklı 150 hastanın dahil edilmesi planlandı. Hastalar, alınan ilk periapikal radyografilerine, anamnezlerine, çalışmaya alınma kriterlerine göre teşhis ve tedavi planlaması yapılarak periapikal doku hastalıklarına göre 5 gruba ayrıldı. Gruplarına göre ayrılan her hastanın kök kanal tedavisine başlarken nekrotik pulpalı kök kanalından ''paper point'' ile örnekler toplandı. Örnekler sıvı tiyoglikolat besiyerine alınarak vakit kaybetmeden hem anaerob hem de aerop kütür işlemlerinin yapılması için Gülhane Eğitim ve Araştırma Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji kliniği laboratuvarına gönderildi. Sıvı besiyerine alınan örnekler 24 saat 37⁰C'de inkübe edildikten sonra aerop ve anaerop kültür işlemine alındı. İnkübasyon süresi sonunda her bir kültürde üreyen farklı morfolojideki bakteri kolonilerinin subkültürü yapıldı. Subkültürlerin etanol-formik asit ekstraksiyon ile Microflex LT sistemi (Bruker Daltonics Inc.Bremen,Germany) MALDI-TOF MS cihazında tanımlamaları yapıldı. Bulgular: Bu çalışmada, 6 filum ve 1 mantarı temsil eden, 77 tür bakteri ve 3 tür Candida tanımlandı. Periapikal doku hastalıklarını, periapikal indekslerini (PAI), hastaların yaşını, cinsiyetlerini laboratuvardan gelen sonuçlardaki tanımlanmış mikroorganizma türleriyle bir veri oluşturduk. Bu verilerin istatistiksel analizleri için kümeleme analizi yöntemi olarak hiyerarşik kümeleme yöntemi kullanılmıştır. Sonuç: MALDI-TOF MS, oral mikrobiyolojinin daha spesifik, kolay, hızlı ve ekonomik bir şekilde geliştirilmesinde potansiyel bir yöntem olabilir. Anahtar kelimeler: Endodonti, Periapikal İndeks (PAI), periapikal doku hastalıkları, anaerop bakteriler, MALDI-TOF MS.