Klinik escherichia coli izolatlarında yüksek riskli st131 klonunun araştırılması
Tezin Türü: Tıpta Uzmanlık
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Sağlık Bilimleri Üniversitesi, İSTANBUL ŞİŞLİ HAMİDİYE ETFAL SAĞLIK UYGULAMA VE ARAŞTIRMA MERKEZİ, TEMEL TIP BİLİMLERİ BÖLÜMÜ, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2019
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: NUR KINA
Danışman: Elif AKTAŞ SEPETCİ
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Amaç: Escherichia coli ST131, CTX-M beta-laktamaz üretimi ve florokinolon direnci ile ilişkili yüksek riskli bir klondur. Türkiye'de E. coli izolatlarında genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) üretimi ve siprofloksasin direnci oldukça yüksek olup ST131 klonuyla ilgili sınırlı sayıda çalışma mevcuttur. Çalışmamızda, klinik E. coli izolatlarında yüksek riskli ST131 klonunun oranını belirlemeyi, ST131 klonuna ait olan ve olmayan izolatlarda antibakteriyel direnç oranlarını karşılaştırmayı ve bu klonun toplum kaynaklı ve sağlık bakımıyla ilişkili enfeksiyonlardaki oranlarını belirlemeyi amaçladık. Gereç ve Yöntem: Çalışmaya Haziran-Eylül tarihleri 2018 arasında Sağlık Bilimleri Üniversitesi Şişli Hamidiye Etfal Eğitim Araştırma Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarına gönderilen klinik örneklerden elde edilen toplam 700 E. coli izolatı dahil edildi. Bakteri tanımlaması ve ST131 klonunun tespiti MALDI-TOF MS (Bruker, Daltonics, Almanya) ile yapıldı. Duyarlılık testleri Phoenix otomatize sistemiyle (Becton Dickinson, ABD) EUCAST kriterlerine göre gerçekleştirildi. Toplum kaynaklı ve sağlık bakımıyla ilişkili enfeksiyonlar Friedman kriterlerine göre tanımlandı. Bulgular: 700 E. coli izolatının 240'ı (%34.3) ST131 klonu olarak tanımlandı. İzolatların 224'ünün (%32) GSBL ürettiği belirlendi. ST131 oranları, GSBL üreten izolatlarda, GSBL üretmeyenlere göre yüksek bulundu (%47.3/%28.2) (p<0,001). ST131 izolatlarında, GSBL üretimi, siprofloksasin ve çeşitli antibakteriyellere direnç ST131 olmayan izolatlara göre yüksek olarak tespit edildi (p<0.001). İzolatların 296'sının (%42) toplum kaynaklı, 93'ü hastane kaynaklı olmak üzere 404'ünün (%58) sağlık bakımıyla ilişkili enfeksiyonlardan elde edildiği belirlendi. Toplum kaynaklı enfeksiyon izolatlarının 103'ü (%34.7), sağlık bakımıyla ilişkili enfeksiyon izolatlarının 137'si (%33.9) ST131 olarak tespit edildi. Toplum kaynaklı ve sağlık bakımıyla ilişkili enfeksiyonlardan elde edilen izolatlar arasında ST131 oranlarında istatistiksel olarak anlamlı fark saptanmadı (p=0.807). Sonuç: Çalışmamızda, ST131 klonu klinik E. coli izolatları arasında yüksek oranda tespit edildi. GSBL üretimi ve çeşitli antimikrobiyallere direnç ile ilişkili bulunan bu klonun, hastane kaynaklı ve diğer sağlık bakımıyla ilişkili enfeksiyonlarda toplum kaynaklı enfeksiyonlardakine benzer oranda tespit edilmesi dikkat çekicidir. Bu yüksek riskli klonun tespiti ve izlenmesi antimikrobiyal direncinin kontrolünde yeni stratejilerin geliştirilmesi açısından oldukça önemlidir. Anahtar kelimeler: E. coli ST131, MALDI-TOF MS, sağlık bakımıyla ilişkili enfeksiyon, toplum kaynaklı enfeksiyon, yüksek riskli klon