Albicans dışı candida türlerinin isimlendirilmesinde iki farklı MALDI-TOF MS yönteminin karşılaştırılması
Tezin Türü: Tıpta Uzmanlık
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Sağlık Bilimleri Üniversitesi, İSTANBUL ŞİŞLİ HAMİDİYE ETFAL SAĞLIK UYGULAMA VE ARAŞTIRMA MERKEZİ, TEMEL TIP BİLİMLERİ BÖLÜMÜ, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2020
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: LEYLA TEKE
Danışman: Banu BAYRAKTAR
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Amaç: İnvaziv mantar enfeksiyonlarında, etkenin hızlı ve doğru bir şekilde tanımlanıp uygun antifungal tedaviye erken başlanması kritik öneme sahiptir. Bu çalışmada, albicans dışı Candida türleri ve nadir maya türlerinin hızlı tanımlanmasında iki MALDI-TOF MS sisteminin karşılaştırılması amaçlanmaktadır. Ayrıca BD Phoenix sisteminin performansı değerlendirildi. Gereç ve Yöntemler: Çalışmada 23 maya türünü içeren 157 maya izolatı, MALDI Biotyper (Bruker Daltonics), VITEK MS (bioMérieux) ve BD Phoenix otomatize sistemi (Becton Dickinson) ile tanımlandı. İzolatlar için, iki MALDI-TOF MS sistemi ile (kabul edilebilir güven değerleri ve skorlarında) aynı isimlendirme sonuçları alınması doğru tanımlama olarak kabul edildi. Tanımlanamayan izolatlarda ve iki MALDI-TOF MS sisteminden alınan uyumsuz sonuçlarda ITS dizi analizi gerçekleştirildi. Bulgular: MALDI Biotyper ile 155 (%98.7) izolat tanımlandı, iki (%1.3) izolat tanımlanamadı. VITEK MS ile 153 (%97.5) izolat tanımlandı, dört izolat (%2.5) tanımlanamadı. İki MALDI-TOF MS sistemi ile tanımlanan mayalar arasında 152 uyumlu ve beş uyumsuz sonuç alındı. Uyumsuz izolatlar ITS dizi analizi ile doğrulandı. VITEK MS sisteminin ITS dizi analizi sonrası Meyerozyma caribbica izolatını yanlış olarak tanımladığı saptandı ve böylece VITEK MS IVD ile doğru tanımlanmış izolat sayısı 152 (%96.8) oldu. BD Phoenix sistemi ile nihai tür tanımına göre; 126 (%80.3) izolat doğru, 22 (%14) izolat yanlış olarak tanımlandı ve dokuz (%5.7) izolat da tanımlanamadı. Mayaların tanımlanmasında MALDI Biotyper, VITEK MS ve BD Phoenix'in doğru tanımlama oranları sırasıyla % 98.7, % 96.8 ve % 80.3 olarak bulundu. Sonuç: Her iki MALDI-TOF MS sistemi de klinik maya izolatlarının tanımlanmasında hızlı ve yüksek performans gösterdi. Meyerozyma caribbica, MALDI-TOF MS sistemleri ile ya Candida guillermondii (yakın ilişkili türler) olarak yanlış tanımlandı ya da tanımlanamadı. Her iki MALDI-TOF MS sistemi de, klinik olarak yaygın olmayan maya türlerinin tanımlanmasında konvansiyonel otomatize tanımlama sistemine göre daha üstündür. MALDI-TOF MS sistemleriyle hızlı ve doğru tanımlama yapılarak, uygun tedaviye kısa sürede başlanması klinik başarının artmasına katkı sağlayacaktır.