Üriner sistem enfeksiyonlarında idrar kültürlerinden izole edilen gram negatif bakterilerde fosfomisin duyarlılığının saptanmasında otomatize sıvı mikrodilüsyon sistemi(vitek-2) ile agar dilüsyon yönteminin karşılaştırılması
Tezin Türü: Tıpta Uzmanlık
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Sağlık Bilimleri Üniversitesi, İSTANBUL HAYDARPAŞA NUMUNE SAĞLIK UYGULAMA VE ARAŞTIRMA MERKEZİ, TEMEL TIP BİLİMLERİ BÖLÜMÜ, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2020
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: EZGİ AKPINAR
Danışman: Sebahat AKSARAY
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:AMAÇ Gram negatif bakterilerde fosfomisin duyarlılığının saptanması için Avrupa Antimikrobiyal Duyarlılık Testleri Komitesi (EUCAST) ve Klinik ve Laboratuvar Standartları Enstitüsü (CLSI) tarafından önerilen referans yöntem agar dilüsyondur. Ancak bu yöntemin mikrobiyoloji laboratuvarlarında rutin olarak uygulanması zordur. Otomatize sistemlerde daha kolay ve pratik bir şekilde antibiyotik duyarlılığı saptanmaktadır. Çalışmamızda fosfomisin duyarlılığını saptamada kullanılan otomatize sıvı mikrodilüsyon sistemi altın standart agar dilüsyon yöntemi ile karşılaştırılarak rutin çalışmalarda kullanılabilirliğinin irdelenmesi amaçlanmıştır. GEREÇ VE YÖNTEM Çalışmamıza Haydarpaşa Numune Eğitim ve Araştırma Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarına 01.06.2019 – 31.12.2019 tarihleri arasında çeşitli kliniklerden gönderilen idrar örneklerinden üriner sistem enfeksiyon etkeni olarak izole edilen toplam 100 adet E.coli ve Klebsiella pneumoniae suşu dahil edilmiştir. MALDI-TOF MS ( bioMerieux, Fransa) ile tanımlanmış ve otomatize sıvı mikrodilüsyon sistemi (Vitek-2, bioMerieux, Fransa) ile antibiyotik duyarlılık testleri yapılmış suşların agar dilüsyon yöntemiyle fosfomisin duyarlılığı çalışılmıştır. İki yöntemin karşılaştırılması amacıyla yapılan değerlendirmede yöntemler arasında, kategorik uyum(KU), temel uyum(TU), çok büyük hata(ÇBH), büyük hata(BH) değerleri hesaplanmıştır. BULGULAR İki yöntemin verileri karşılaştırıldığında KU; E.coli suşları için %100, K.pneumoniae suşları için %95,5 olarak saptanmıştır. E.coli suşları için BH ve ÇBH saptanmamıştır. K.pneumoniae suşlarında ise ÇBH saptanmazken, %18 oranında BH saptanmıştır. SONUÇ Çalışmamızda kategorik uyum oranlarının yüksek olmasına dayanarak Vitek-2 sisteminin rutin laboratuvarda kullanımının uygun olacağı düşünülmüştür. Ancak özellikle K.pneumoniae suşlarındaki yüksek hata oranları nedeniyle özellikle dirençli sonuçlar alınan izolatlarda referans yöntemle konfirme edilmeden sonuçların raporlanmaması gerektiği kanaati oluşmuştur. ANAHTAR KELİMELER: Fosfomisin, agar dilüsyon, otomatize sıvı mikrodilüsyon yöntemi, Vitek-2, gram negatif bakteri