Kan kültürü örneklerinden izole edilen candıda türlerinde antifungal duyarlılığın saptanmasında iki farklı ticari sistemin standart sıvı mikrodilüsyon yöntemi ile karşılaştırılması
Tezin Türü: Tıpta Uzmanlık
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Sağlık Bilimleri Üniversitesi, İSTANBUL HAYDARPAŞA NUMUNE SAĞLIK UYGULAMA VE ARAŞTIRMA MERKEZİ, TEMEL TIP BİLİMLERİ BÖLÜMÜ, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2020
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: NİHAN YILDIZ
Danışman: Rıza ADALETİ
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:AMAÇ Standart antifungal duyarlılık testi (AFDT) olan sıvı mikrodilüsyon (SMD) yönteminin uygulanması klinik laboratuvarlar için zaman alıcı ve uygulanması zordur. Günümüzde manuel, yarı otomatize ve otomatize yöntemler de dahil olmak üzere bulunan bazı yöntemlerin uygulanması daha kolay olup rutin kullanımda Candida spp., Cryptococcus türleri ve filamentöz mantarlara karşı in vitro antifungal ilaçları test etmek için kullanılan alternatif diğer yöntemler bulunmaktadır. Bu çalışmada piyasada bulunan iki farklı ticari yöntemin [SensititreYeastOne (TrekDiagnosticSystem, USA) ve Vitek-2 (bioMérieux,Fransa)] altın standart SMD yöntemiyle karşılaştırılması amaçlanmıştır. GEREÇ VE YÖNTEM Çalışmamıza 01.01.2018-31.12.2018 tarihleri arasında İstanbul Kamu Hizmetleri Başkanlığı 2. hizmet bölgesinde bulunan hastanelerin çeşitli kliniklerinden mikrobiyoloji laboratuvarlarına gönderilen kan kültürlerinden izole edilen 127 Candida suşu dahil edilmiştir. İzolatların tanımlanması matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyon/iyonizasyon uçuş zamanı kütle spektrometresi [MALDI TOF-MS (bio-Mérieux, France)], AFDT ise kolorimetrik mikrodilüsyon testi [SensititreYeastOne (TREK Diagnostic Systems Inc., Westlake, Ohio)], otomatize Vitek-2 (bioMérieux,Fransa) ve standart SMD testi ile merkez laboratuvarımızda yapılmıştır. Her üç yöntemin karşılaştırılması amacıyla yapılan değerlendirmede; veri analizi, Antimikrobiyal Duyarlılık Testleri (ADT) için Amerikan gıda ve ilaç dairesi (USA Food and Drug Administration) klavuzuna göre yapılmıştır. Buna göre yöntemler arasında ADT'de, esansiyel uyum (EU), kategorik uyum (KU), mod, çok büyük hata (ÇBH), büyük hata (BH) ve küçük hata (KH) değerleri hesaplanmıştır. BULGULAR Her üç yöntemin verileri karşılaştırıldığında KU değerlendirilmesinde C.tropicalis'te posakonazol için %80 ve az sayıda izole edilen türleri de içeren toplam değerlendirmede KU posakonazol için %97.6 ve vorikonazol için %96.9 olarak saptanmıştır. Bunların dışında kalan izolatlarda tüm antifungaller için KU %100 olarak saptanmıştır. Her iki ticari yöntemde esansiyel uyum %17-100 arasında değişmektedir. Buna göre C. albicans izolatlarının amfoterisin B ile EU'su hem YeastOne (%34) hem de Vitek-2 (%23) sistemi ile düşük saptanmıştır. Candida albicans izolatlarının vorikonazol için Vitek-2 (%17.1) yöntemi ile EU'su düşük saptanmıştır. Candida glabrata suşlarında özellikle azol grubunda 24. saat uyum oranları 48. saatlik uyum oranlarına göre daha düşük saptanmıştır. SONUÇ Kategorik uyum sonuçlarımıza göre, uygulanması ve yorumlanması daha kolay olan aynı zamanda daha kısa sürede sonuç veren bu iki ticari yöntemin standart SMD yöntemi ile uyumlu olduğu ve rutin laboratuvar işleyişinde kullanılabileceği düşünülmüştür. Bu ticari yöntemlerin maliyeti yüksek gibi görünmekle birlikte erken ve doğru antifungal tedavinin hasta sonuçları üzerine yapacağı etkiler ile, yoğun bakım yatış süresini kısaltmak gibi maliyet etkin olacağı düşünülmüştür. ANAHTAR KELİMELER: Candida spp., antifungal duyarlılık testleri, sıvı mikrodilüsyon yöntemi, SensititreYeastOne, Vitek-2