Kan kültüründen matriks destekli lazer desorpsiyon iyonizasyon uçuş süresi kütle spektrometrisi (MALDI-TOF MS) ile direkt hızlı tanımlama

---

Tezin Türü: Tıpta Uzmanlık

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Sağlık Bilimleri Üniversitesi, İSTANBUL ŞİŞLİ HAMİDİYE ETFAL SAĞLIK UYGULAMA VE ARAŞTIRMA MERKEZİ, TEMEL TIP BİLİMLERİ BÖLÜMÜ, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2021

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: HAZAN ZENGİN CANALP

Danışman: Banu BAYRAKTAR

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Amaç: Kan dolaşımı enfeksiyonlarında etkenin hızlı tanımlanması, hasta tedavi yönetiminde kritik öneme sahiptir. Bu çalışmada pozitif kan kültürü şişesinden direkt MALDI-TOF MS ile hızlı tanımlamanın uygulanabilirliği, doğruluğu ve kısa inkübasyon süreli rutin tanımlamaya göre sonuç verme süresine olan katkısının ortaya koyulması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntemler: Çalışmaya BACTEC FX (Becton Dickinson) sistemiyle pozitif sinyal alınan 328 kan kültürü dahil edildi. Her hasta için eş zamanlı alınan kan örneklerinden yalnızca ilk üreme olan şişe çalışmaya alındı. Tüm örneklerden Gram boyama, koyun kanlı agar (KKA) ve çikolata agara ekim yapıldı. Kısa inkübasyon süreli rutin yöntemde agar plaklarda görülen üremeler; hızlı yöntemde ise kan kültürü şişelerinden serum seperatör tüp (BD Vacutainer SSTII Advance) kullanılarak hazırlanan pelletler MALDI Biotyper (Bruker Daltonics) ile tanımlandı. Hızlı tanımlama sonuçlarının rutin ile uyumu değerlendirildi. Hızlı ve rutin yöntemle elde edilen sonuç verme süreleri karşılaştırıldı. Bulgular: Kısa inkübasyon süreli rutin yöntemle tüm izolatlar tür düzeyinde doğru olarak tanımlandı. Hızlı tanımlama yöntemiyle 310 monomikrobiyal örneğin 295'inde (%95.2) sonuç elde edilirken; 15'inde (%4.8) sonuç elde edilemedi. 295 örnekten; 289'u (%97.9) tür düzeyinde doğru, 4'ü (%1.4) cins düzeyinde doğru, 2'si (%0.7) yanlış tanımlandı. Hızlı tanımlamada 1.2, 1.3, 1.4 ve 1.5 skor eşik değerlerinde tür düzeyinde doğru tanımlama oranları sırasıyla; %97.9, %98.9, %99.3 ve %100 olarak bulundu. Gündüz sinyal grubunda ortalama sonuç verme süresi, hızlı tanımlamada (Ort:2.86; %95 GA:2.65-3.07) rutin tanımlamaya (Ort:19.49; %95 GA: 18.08-20.89) göre istatistiksel olarak anlamlı derecede düşük tespit edildi (p<0.001). Sonuç: Çalışmamızda ek donanım gerektirmeyen ve kolay uygulanan hızlı tanımlama yöntemiyle, %93.2 oranında tür düzeyinde doğru sonuçlar alınmıştır. Hızlı tanımlama ile gündüz sinyal grubunda ortalama sonuç verme süresi, kısa inkübasyon süreli rutin tanımlamaya göre 16.6 saat kadar kısaltılmıştır. Bu yöntemle sonuç verme süresinin iyileştirilmesinin hasta yönetimine olumlu katkı sağlayacağı düşünülmektedir.