Sağlıklı çocuklarda yüksek riskli escherichia coli SE131 klonu taşıyıcılığının araştırılması
Tezin Türü: Tıpta Uzmanlık
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Sağlık Bilimleri Üniversitesi, İSTANBUL ŞİŞLİ HAMİDİYE ETFAL SAĞLIK UYGULAMA VE ARAŞTIRMA MERKEZİ, TEMEL TIP BİLİMLERİ BÖLÜMÜ, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2022
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: FERİDE MERVE ARSLAN
Danışman: Elif AKTAŞ SEPETCİ
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Amaç: Escherichia coli sekans tip 131 (ST131), CTX-M beta-laktamaz üretimi ve florokinolon direnci ile ilişkili bir pandemik klondur. ST131'in bağırsak kolonizasyonu, önemli sistemik enfeksiyonlara yol açabilir. Ülkemizde antimikrobiyal direnç kritik derecede yüksektir. Türkiye'de sağlıklı çocuklarda E.coli ST131 klonunun intestinal kolonizasyonu ile ilgili bir çalışma bulunmamaktadır. Bu çalışmanın amacı, E.coli ST131'in intestinal kolonizasyon prevalansını belirlemek, bu klonun dışkı ve klinik örnekler arasındaki oranlarını karşılaştırmak ve ST131 taşıyıcılığı için risk faktörlerini değerlendirmektir. Gereç ve Yöntem: Bu prospektif çalışmada, sağlıklı çocuklardan dışkı örnekleri ve pediatri bölümlerinden gönderilen çeşitli klinik örnekler Nisan-Kasım 2021 tarihleri arasında toplanmıştır. Bakteriyel tanımlama Matriks Aracılı Lazer Desorpsiyon-İyonizasyon Uçuş Zamanı Kütle Spektrometresi (MALDI-TOF MS) (bioMerieux, Marcy l'Etoile, Fransa) tarafından yapılmıştır. Duyarlılık testleri disk difüzyon yöntemi ve Vitek ® 2 otomatik sistem (bioMerieux, Marcy l'Etoile, Fransa) kullanılarak EUCAST yönergeleri izlenerek yapılmıştır. E.coli ST131'in MALDITOF MS tarafından tespiti, Lafolie tarafından tarif edildiği gibi yapılmıştır. Yaş, cinsiyet, doğum şekli, son üç ayda antibiyotik kullanımı, son altı ayda enfeksiyon geçirme öyküsü, hastaneye yatış öyküsü, kardeş sayısı, evde hayvan besleme durumunu içeren bilgiler, sağlıklı çocuklardan ST131 fekal taşıyıcılığı risk faktörlerini belirlemek üzere toplanmıştır. Bulgular: Toplam 340 dışkı izolatı ve 200 klinik izolat analiz edilmiştir. Dışkı örnekleri toplanan sağlıklı çocuk popülasyonunda kız ve erkek cinsiyet dağılımı %49,7 ve %50,3 ve yaş ortalaması 6.9±5.3 (0-17) iken, klinik izolatlar için sırasıyla %81,5, %18.5 ve 7.5±5.0 (0-17) olarak belirlenmiştir. Dışkı ve klinik izolatlar arasında cinsiyete ve yaşa göre ST131 pozitifliği açısından anlamlı fark bulunmamıştır. Dışkı izolatları ile klinik izolatlar arasındaki ST131 oranları arasındaki fark anlamlı derecede yüksek saptanmıştır (%24,7'ye karşı %44,5, p<0,001). Dışkı ve klinik izolatlarda GSBL pozitiflik oranı sırasıyla %28.6 ve %22.5 olarak bulunmuştur. ST131 dışkı ve klinik izolatların siprofloksasin direnci sırasıyla %22,6, %18 olarak belirlenmiş olup fekal ve klinik izolatlar arasında siprofloksasine direnç açısından anlamlı bir fark bulunmamıştır. ST131 taşıyıcılığı olan sağlıklı çocuklarda ST131 taşıyıcılığı olmayan çocuklara göre sezaryen doğum oranı anlamlı derecede düşük, kardeş varlığı oranı ise anlamlı derecede yüksek saptanmıştır (p=0,002, p=0,042). Sonuç: E. coli ST131 klonu, pediatrik popülasyonda önemli bir enfeksiyon nedenidir. Çalışmamızda hem sağlıklı çocuklardan elde edilen dışkı örneklerinde hem de pediatri bölümlerinden gönderilen klinik örneklerde yüksek oranda ST131 klonu bulunmuştur. ST131 izolatlarında, pediatrik popülasyonda yaygın olarak kullanılmayan siprofloksasine karşı yüksek direnç oranları, dolaşımdaki yüksek riskli klonların etkisinin önemini gösterebilir.