Crohn hastalarında mikrobiyata karakterizasyonu ve inflamazom bileşenlerinin rolü


Tezin Türü: Doktora

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Sağlık Bilimleri Üniversitesi, HAMİDİYE SAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, TIBBİ BİYOLOJİ ANABİLİM DALI, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2022

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: DUYGU KIRKIK

Danışman: Sevgi KALKANLI TAŞ

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Amaç: Doğal ve edinsel immünitenin birlikte rol aldığı bir immün reaksiyon olan inflamasyon, patojenlere karşı konakçı savunmasında hayati önem taşımaktadır. Genetik, çevre ve immünolojik ortamdan etkilenen Crohn Hastalığı, idiyopatik inflamatuar bir hastalık olduğu için çalışmamızda Crohn hastaları ve sağlıklı bireylerin kan mikrobiyatasındaki farklılıkları, inflamazom bileşenlerinin yanıtlarıyla değerlendirmeyi amaçladık. Gereç ve Yöntem: Çalışmamıza; 10 yeni tanı almış Crohn hastası, 10 anti-TNF ilaç alan Crohn hastası ve 20 kontrol olmak üzere 40 gönüllü dahil edildi. Kan örneklerinin tamamından 16S rRNA yöntemiyle V3-V4 bölgeleri dizilendi. Sonrasında ise NLRP3 proteini Western Blot yöntemi ile, IL-1β ve IL-18 serum profilleri ise ELISA yöntemiyle değerlendirildi. Bulgular: Çalışmamızda hastaların kanında 5 farklı filum bulundu. Yeni tanı almış Crohn hastaları ve anti-TNF ilaç alan Crohn hastalarında NLRP3 proteininin çok yüksek miktarda bulunduğu, kontrol grubunda ise hiç bulunmadığı tespit edildi. Inflamazom bileşenleri olan IL-1β serum seviyesinin hasta grubunda daha az, kontrol grubunda ise daha yüksek olduğu (p=0,0041) ve IL-18 serum seviyesinin ise hastalarda yüksek miktarda (p=0,8209) sağlıklı bireylerde ise az miktarda olduğu tespit edildi. Sonuç: Çalışmamız; Crohn hastaları ve kontrollerin kan mikrobiyal profillerinde olan önemli değişiklikleri ve klinik olarak önemli bir patojen olan Staphyloccus sciuri'nin varlığını ortaya koymaktadır. Sonuçlarımıza göre doğal ve edinsel immün yanıtta önemli bir rolü olan NLRP3 proteininin Crohn hastalarında aşırı ekspresyonunun gözlemlenmesi, hastalığın teşhisinde kullanılabilecek bir biyobelirteç olabileceğini göstermektedir. Bu çalışma ayrıca IL-1β ve IL-18 hakkında keşfedilecek daha çok biyolojik ve fizyolojik mekanizmaların olduğunu göstermektedir. Anahtar Kelimeler: Crohn Hastalığı, IL-18, IL-1β, İnflamazom, Mikrobiyom, NLRP3