Epitelyal over tümörlerinde MR radiomikleri kullanılarak histopatolojik özelliklerin öngörülmesi

---

Tezin Türü: Tıpta Uzmanlık

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Sağlık Bilimleri Üniversitesi, HAMİDİYE ULUSLARARASI TIP FAKÜLTESİ, DAHİLİ TIP BİLİMLERİ BÖLÜMÜ, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2023

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: ZEYNEP NİHAN ÇIKIM

Danışman: Aytül Hande YARDIMCI

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Amaç Çalışmanın amacı preoperatif tanısı olgu yönetimi ve tedavi şeklinin belirlenmesinde kritik öneme sahip olan epitelyal over tümörlerinde MR radiomikleri kullanılarak histopatolojik özelliklerin öngörülebilmesidir. Gereç ve Yöntem Çalışmamıza 2020-2022 yılları arasında hastanemizde opere edilen toplam 75 olguya ait histopatolojik tanısı benign, borderline ve malign olarak doğrulanmış 102 tümör dahil edilmiştir. Olgulara preoperatif dönemde evreleme amaçlı yapılan 1.5T MR görüntülemede ADC, T1C+ ve T2 sekansları üzerinde en büyük tek aksiyel kesit yöntemiyle 15 yıllık deneyimli radyolog gözetmenliğinde genç asistan radyolog tarafından açık kaynak kodlu 3D Slicer 5.2 yazılımıyla manuel segmentasyon yapılmıştır. Life X açık kaynak kodlu yazılımının 7.3 sürümüyle tümörlere ait segmente görüntülerde gerekli işlemler (post-processing) uygulanmış ve sonrasında ADC, T1C+ ve T2 sekanslarının her birinde o tümöre ait birinci derece radiomik özellikleri (histogram) içeren radiomik veriler (featurelar) çıkarılmıştır. Bu özelliklere ait istatistikler açık kaynak kodlu R yazılımıyla multinominal LASSO analizi kapsamında bilgi kriterleri ve çapraz geçerlilik regresyon modeli olmak üzere 2 farklı model ile elde edilmiştir. Bulgular Benign, borderline ve malign tümörlerde her bir sekans için yapılan radiomik analizlerde multinominal LASSO kapsamında oluşturulan iki istatistiksel modelden çapraz geçerlilik regresyon analizinin bilgi kriterleri analizine göre daha yüksek performans gösterdiği bulunmuştur. Çapraz geçerlilik istatistik modeliyle elde edilen üç sınıflı ROC analizlerinde benign, borderline ve malign tümörlerde sırasıyla ADC sekansında 0.95, 0.85 ve 0.95; T1C+ sekansında 0.94, 0.80, ve 0.88; T2 sekansında 0.89 ,0.76 ve 0.91 oranlarında AUC ile yüksek doğruluk oranlarına ulaşılmıştır. ADC sekansı üç tümör tipini öngörmede de diğer iki sekanstan daha başarılı bulunmuştur. Sonuç Epitelyal over tümörlerinde MR radiomikleri ile elde edilen histogram parametreleri tanı aşaması ve tedavi yönlendirmede, tümör subtiplerini öngörmede önemli oranda katkı sağlamaktadır. Gelecekte çok merkezli ve daha büyük veri setleriyle yapılan, volümetrik segmentasyon yöntemi uygulanan ve klinik parametrelerle kombine edilen çalışmalarla oldukça yüksek doğruluk oranları elde edilebileceği düşünülmektedir. Anahtar Kelimeler: Over, radiomiks, tümor, manyetik rezonans görüntüleme.